MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16L

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021520	TAAAAC	2	12	71	82	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021520	GA	3	6	111	116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021520	AAC	2	6	199	204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844558
4	NC_021520	ACA	3	9	284	292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844558
5	NC_021520	AC	3	6	336	341	50 %	0 %	0 %	50 %	513844558
6	NC_021520	TTA	2	6	350	355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844558
7	NC_021520	CAA	2	6	508	513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844558
8	NC_021520	GTT	2	6	546	551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844558
9	NC_021520	TGG	2	6	555	560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844558
10	NC_021520	TAAAT	2	10	751	760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021520	A	7	7	765	771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021520	CTA	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021520	GTAG	2	8	855	862	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021520	CAAG	2	8	925	932	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021520	GCC	2	6	1003	1008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021520	TTC	2	6	1053	1058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021520	CACG	2	8	1072	1079	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021520	GGGC	2	8	1080	1087	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021520	AAC	2	6	1137	1142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021520	AAAT	2	8	1146	1153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021520	T	7	7	1179	1185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021520	TTAG	2	8	1196	1203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021520	AAC	2	6	1265	1270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021520	TCT	2	6	1280	1285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021520	TTA	2	6	1424	1429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021520	AACT	2	8	1466	1473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021520	GACA	2	8	1480	1487	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021520	TA	3	6	1500	1505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021520	AAT	2	6	1592	1597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021520	AT	3	6	1687	1692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021520	AAC	2	6	1712	1717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021520	TTA	2	6	1746	1751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021520	TAG	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021520	ATGAC	2	10	1827	1836	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_021520	ACT	2	6	1844	1849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021520	TAACT	2	10	1855	1864	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021520	TAT	2	6	1905	1910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021520	TTA	2	6	1924	1929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021520	TAA	2	6	1930	1935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021520	CTAT	2	8	1942	1949	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021520	CTT	2	6	2074	2079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021520	T	6	6	2105	2110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021520	ATA	2	6	2181	2186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021520	TG	3	6	2242	2247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021520	AGTT	2	8	2359	2366	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021520	T	7	7	2365	2371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021520	CAA	2	6	2378	2383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021520	TA	4	8	2449	2456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021520	CAAAA	2	10	2464	2473	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021520	TAA	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021520	TCT	2	6	2535	2540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021520	T	6	6	2545	2550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021520	AGCA	2	8	2654	2661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021520	TCA	2	6	2664	2669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021520	CTTT	2	8	2683	2690	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021520	AAT	2	6	2720	2725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021520	ACA	2	6	2752	2757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021520	A	6	6	2812	2817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021520	A	6	6	2894	2899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021520	ATG	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021520	TAA	2	6	2980	2985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021520	ATT	2	6	3077	3082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
63	NC_021520	T	6	6	3118	3123	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
64	NC_021520	A	7	7	3143	3149	100 %	0 %	0 %	0 %	513844559
65	NC_021520	TTA	3	9	3157	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
66	NC_021520	TTTC	2	8	3176	3183	0 %	75 %	0 %	25 %	513844559
67	NC_021520	TCAACA	2	12	3218	3229	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	513844559
68	NC_021520	T	6	6	3254	3259	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
69	NC_021520	T	6	6	3319	3324	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
70	NC_021520	TG	4	8	3407	3414	0 %	50 %	50 %	0 %	513844559
71	NC_021520	A	6	6	3429	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	513844559
72	NC_021520	ACT	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844559
73	NC_021520	T	6	6	3478	3483	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
74	NC_021520	GTAT	2	8	3559	3566	25 %	50 %	25 %	0 %	513844559
75	NC_021520	ATGG	2	8	3589	3596	25 %	25 %	50 %	0 %	513844559
76	NC_021520	TG	3	6	3655	3660	0 %	50 %	50 %	0 %	513844559
77	NC_021520	T	6	6	3673	3678	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
78	NC_021520	A	6	6	3696	3701	100 %	0 %	0 %	0 %	513844559
79	NC_021520	TTC	2	6	3703	3708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844559
80	NC_021520	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	513844559
81	NC_021520	AAC	2	6	3793	3798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844559
82	NC_021520	TCA	2	6	3817	3822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844559
83	NC_021520	TTA	2	6	3853	3858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
84	NC_021520	TAT	2	6	3920	3925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
85	NC_021520	GAATTA	2	12	3943	3954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	513844559
86	NC_021520	TA	3	6	3980	3985	50 %	50 %	0 %	0 %	513844559
87	NC_021520	AAT	2	6	4010	4015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844559
88	NC_021520	TA	4	8	4146	4153	50 %	50 %	0 %	0 %	513844559
89	NC_021520	AT	3	6	4197	4202	50 %	50 %	0 %	0 %	513844559
90	NC_021520	TTAT	2	8	4227	4234	25 %	75 %	0 %	0 %	513844559
91	NC_021520	T	6	6	4249	4254	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
92	NC_021520	GAC	2	6	4406	4411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844559
93	NC_021520	TAG	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844559
94	NC_021520	ATT	2	6	4493	4498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
95	NC_021520	ATC	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844559
96	NC_021520	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844559
97	NC_021520	TAA	2	6	4663	4668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844559
98	NC_021520	T	7	7	4686	4692	0 %	100 %	0 %	0 %	513844559
99	NC_021520	AAC	2	6	4721	4726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844559
100	NC_021520	A	6	6	4846	4851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021520	TC	3	6	4864	4869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021520	T	7	7	4874	4880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021520	GAT	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021520	T	6	6	4895	4900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021520	TTTA	2	8	4908	4915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021520	TTA	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021520	AT	3	6	5153	5158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021520	GTT	2	6	5319	5324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021520	CT	4	8	5336	5343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021520	CAA	2	6	5345	5350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021520	T	6	6	5517	5522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021520	TA	3	6	5561	5566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021520	TA	3	6	5665	5670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021520	CTT	2	6	5681	5686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021520	TCA	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021520	AAT	2	6	5709	5714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844560
117	NC_021520	ATT	2	6	5727	5732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844560
118	NC_021520	TCT	2	6	5733	5738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844560
119	NC_021520	TTC	2	6	5741	5746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844560
120	NC_021520	TCA	2	6	5772	5777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844560
121	NC_021520	TAA	2	6	5819	5824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844560
122	NC_021520	ACT	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844560
123	NC_021520	GAT	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844560
124	NC_021520	AT	3	6	6010	6015	50 %	50 %	0 %	0 %	513844560
125	NC_021520	TTGG	2	8	6119	6126	0 %	50 %	50 %	0 %	513844561
126	NC_021520	T	6	6	6131	6136	0 %	100 %	0 %	0 %	513844561
127	NC_021520	ATC	2	6	6190	6195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844561
128	NC_021520	GTT	2	6	6204	6209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844561
129	NC_021520	TAA	2	6	6210	6215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844561
130	NC_021520	AGC	2	6	6232	6237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844561
131	NC_021520	TAA	2	6	6276	6281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844561
132	NC_021520	ATT	3	9	6304	6312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844561
133	NC_021520	CAAGT	2	10	6314	6323	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021520	CAA	2	6	6377	6382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021520	GCTAA	2	10	6431	6440	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021520	TCA	2	6	6441	6446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.